La Fundación Hondureña de Investigación Agrícola – FHIA, fue constituida el 15 de mayo de 1984 como organización privada, apolítica y no lucrativa, con la función principal de realizar investigación y transferencia de tecnologías para cultivos de exportación tradicionales y de diversificación.

El Ministerio de Agricultura y Ganadería y la Agencia Internacional para el Desarrollo de los Estados Unidos (USAID) diseñaron el proyecto de creación de la Fundación conjuntamente en 1984. Simultáneamente, se aprovechó la decisión de la United Brands Company de terminar sus actividades de investigación sobre banano en La Lima, Cortés, y de transferir las instalaciones al Gobierno de Honduras. Es así como en 1984 se decidió crear la Fundación en las instalaciones de esta compañía. En la actualidad la organización todavía opera desde allí. La Fundación cuenta con sus instalaciones en La Lima, Cortés, y con cuatro Centros Experimentales y Demostrativos localizados en diferentes regiones agro-climáticas del país.

El máximo organismo de la FHIA es su Asamblea. El Consejo de Administración, elegido por la Asamblea, está constituido por 9 personas, de las cuales su presidente es el Ministro de Agricultura y Ganadería y representa al Gobierno de Honduras. Los restantes miembros del Consejo de Administración son socios de la Fundación, representantes del sector privado empresarial del país.